1) no sé cómo va el tema en Node porque lo evito tanto como puedo pero...
2) normalmente fijo la versión de las librerías que uso. No tiene sentido que una actualización grande te pueda parar un proyecto por muy pequeño que este sea.

Por otro lado
3) me parece bastante mal que github le quite el acceso a su trabajo.

Este es un buen aviso a navegantes: cuidado con los repositorios "gratis" que pueden salir bien caros